戊寅，回纥俟利发吐迷度、仆骨俟利发歌滥拔延、多滥葛俟斤末、拔野古俟利发屈利失、同罗俟利发时健啜、思结酋长乌碎及浑、斛薛、奚结、阿跌、契苾、白靑酋长皆来朝。庚辰，上赐宴于芳兰殿，命有司厚加给待，每五日一会。
时太子当从行，少詹事张行成上疏，觉得：“皇太子从幸灵州，不若使之监国，接对百寮，明习庶政，既为京师重镇，且示四方大德。宜割私爱，俯从公道。”上觉得忠，进位银青光禄大夫。
贞观二十一年丁未，公元六四七年春，正月，开府仪同三司申文献公高士廉疾笃；辛卯，上幸其第，流涕与诀；壬辰，薨。大将往哭之，房玄龄以上疾新愈，固谏，上曰：“高公非徒君臣，兼以故旧姻戚，岂得闻其丧不往哭乎？公勿复言！”帅摆布自兴安门出。长孙无忌在士廉丧所，闻大将至，辍哭，迎谏于马首曰：“陛下饵金石，于方不得临丧，何如不为宗庙百姓自重！且臣舅临终遗言，深不欲以北首、夷衾，辄屈銮驾。”上不听。无忌中道伏卧，流涕固谏，上乃还入东苑，南望而哭，涕下如雨。及柩出横桥，上登长安故城西北楼，望之恸哭。
夏，四月，甲子，太子太保萧瑀解太保，乃同中书门下三品。
八月，甲子，立皇孙忠为陈王。
壬申，上幸汉故甘泉宫，诏以“戎、狄与六合俱生，上皇并列，流殃构祸，乃自运初。朕聊命偏师，遂擒颉利；始弘庙略，已灭延陀。铁勒百馀万户，散处北溟，远遣令人，委身内属，请同编列，并为州郡；混元以降，殊未前闻，宜备礼告庙，仍颁示普天。”
房玄龄尝以微谴归第，褚遂良上疏，觉得：“玄龄自义旗之始翼赞圣功，武德之季冒死决策，贞观之初选贤立政，人臣之勤，玄龄为最。自非有罪在不赦，搢绅同尤，不成遐弃。陛下若以其朽迈，亦当讽谕使之致仕，退之以礼；不成以浅鲜之过，弃数十年之勋旧。”上遽召出之。顷之，玄龄复避位还家。久之，上幸芙蓉园，玄龄敕后辈汛扫门庭，曰：“乘舆且至！”有顷，上果幸其第，因载玄龄还宫。
上尝幸未央宫，辟仗已过，忽于草中见一人带横刀，诘之，曰：“闻辟仗至，惧不敢出，辟仗者不见，遂伏不敢动。”上遽引还，顾谓太子：“兹事行之，则数人当死，汝于后速纵遣之。”又尝乘腰舆，有三卫误拂御衣，其人惧，色变。上曰：“其间无御史，吾不汝罪也。”
敕勒九姓酋长，以其部落素服薛延陀种，闻咄摩支来，皆惊骇，朝议恐其为碛北之患，乃更遣李世勣与九姓敕勒共图之。上戒世勣曰：“降则抚之，叛则讨之。”己丑，上手诏，以“薛延陀幻灭，其敕勒诸部，或来降附，或未归服，今不乘机，恐贻悔怨，朕当自诣灵州招安。其去岁征辽东兵，皆不调发。”