义熙元年乙巳，公元四零五年春，正月，南阳太守扶风鲁宗之起兵袭襄阳，桓蔚走江陵。己丑，刘毅等诸军至马头。桓振挟帝出屯江津，遣使求割江、荆二州，馈送天子；毅等不准。辛卯，宗之击破振将温楷于柞溪，进屯纪南。振留桓谦、冯该守江陵，引兵与宗之战，大破之。刘毅等击破冯该于豫章口，桓谦弃城走。毅等入江陵，执卞范之等，斩之。桓振还，瞥见火起，知城已陷，其众皆溃，振逃于涢川。
超恐为秦人所录，乃阳狂行乞；秦人贱之，惟东平公绍见而异之，言于秦王兴曰：“慕容超姿干瑰伟，殆非真狂，愿微加官爵以縻之。”兴召见，与语，超故为谬对，或问而不答。兴谓绍曰：“谚云‘妍皮不裹痴骨，’徒妄言耳。”乃罢遣之。
北青州刺史刘该反，引魏为援，清河、阳平二郡太守孙全聚众应之。六月，魏豫州刺史索度真、大将斛斯兰寇徐州，围彭城。刘裕遣其弟南彭城内史道怜、东海太守孟龙符将兵救之，斩该及全，魏兵败走。龙符，怀玉之弟也。
夏，四月，刘裕旋镇京口，改授都督荆、司等十六州诸军事，加领兖州刺史。
燕王熙至陉北，畏契丹之众，欲还，苻后不听，戊申，遂弃辎重，轻兵袭高句丽。
蒲月，桂阳太守章武王秀及益州刺史司马轨之谋反，伏法。秀妻，桓振之妹也，故自疑而反。桓玄馀党桓亮、苻宏等拥众寇乱郡县者以十数，刘毅、刘道规、檀祗平分兵讨灭之，荆、汀、江、豫皆平。诏以毅为都督淮南等五郡军事、豫州刺史，何无忌为都督江东五郡军事、会稽内史。
十仲春，燕王熙袭契丹。
乞伏乾归击吐谷浑大孩，大破之，俘万馀口而还，大孩走死胡园。视罴世子树洛干帅其馀众数千家奔莫何川，自称车骑大将军、大单于、吐谷浑王。树洛干轻徭薄赋，信赏必罚，吐谷浑答复，沙、□诸戎皆附之。
刘裕遣使乞降于泰，且求南乡等诸郡，秦王也许之。群臣咸觉得不成，兴曰：“天下之善一也。刘裕拔起纤细，能讨诛桓玄，兴复晋室，内釐庶政，外修封疆，吾何惜数郡，不以成其美乎！”遂割南乡、顺阳、新野、舞阴等十二郡归于晋。
益州刺史司马荣期击谯明子于白帝，破之。
晋纪三十六（起旃蒙大荒落，尽著雍涒滩，凡四年）
西凉公暠自称大将军、多数督、领秦、凉二州牧，大赦，改元建初，遣舍人黄始梁兴间行奉表诣建康。
备德闻超至，大喜，遣骑三百迎之。超至广固，以金刀献于备德。备德恸哭，悲不自胜。封超北海王，拜侍中、骠骑大将军、司隶校尉、开府，妙简时贤，为之僚佐。备德无子，欲以超为嗣。超入则奉养尽欢，出则倾身下士，由是表里誉望翕然归之。